Myndun náttúrulegs sódavatns hefst með því að úrkoma (rigning og snjór) síast inn í grunnvatnið. Þetta vatn er síðan síað í gegnum berglög eins og sandstein, samsteypu og kalkstein með vel-þróuðum sprungum, gangast undir hæg efnahvörf djúpt neðanjarðar sem geta varað frá áratugum upp í hundruð eða jafnvel tugþúsundir ára.
Steinefnamyndun felur fyrst og fremst í sér upplausn, skipti á aðsoguðum katjónum, afoxunarhvörf, uppgufun og þéttingu og blöndun.
Vatn sem rennur í gegnum ákveðin berglög, eins og kalksteinn og dólómít, leysir upp steinefni og myndar sódavatn ríkt af kalsíum og magnesíum. Eldfjallaberg, eins og granít, er ríkt af metasilicic sýru. Ógegndræp berglög fyrir ofan vatnslögn, eins og leirsteinn og leirsteinn, veita vernd.
Jarðefnavatn er geymt í neðanjarðarvatnslögnum og kemur náttúrulega út um jarðfræðileg misgengissvæði til að mynda artesian lindir, eða er unnið með gerviborun. Ef tekið er Jinjiang náttúrulegt sódavatn í Manjiang Town, Fusong sýslu, Jilin héraði sem dæmi, er það staðsett í norðvestur-vænni þjöppunarmisferli-. Við flæði grunnvatns meðfram misgenginu leysir það upp og auðgar leysanlega steinefnaþætti eins og SiO₂ í nærliggjandi bergi og myndar sódavatn af metasílsýrugerð.
